CRISPRのバリデーション
ゲノム編集技術、すなわちCRISPR/Cas9における近年の進化により、細胞株のエンジニアリングや遺伝子ターゲティング、トランスジェニックモデルの開発は大幅に進展されました。しかしながら、大規模なプロジェクトを進めていく上で、標的細胞の正確な識別が未だに重大な課題になっています。
このハードルを克服するため、AzentaはgenoTYPER-NEXT™を開発しました。これは、スループットに優れ、高感度でのジェノタイピングを可能にする、独自に開発したNGSベースのアッセイです。このツールは、対象細胞株
のスクリーニングにおいて、T7E1やTIDE、IDAAよりも高い有効性と効率を発揮します。
当社ではまた、ゲノム編集の オンターゲット、オフターゲット解析,を補助できるよう、全ゲノムあるいは 標的領域のシークエンシング によるNGSソリューションも提供しています。
genoTYPER-NEXT: HIGH-THROUGHPUT ASSAY FOR CRISPR VALIDATION
1. SUBMIT SAMPLES
Submit CRISPR-edited cell lines in 96-well plates
2. AMPLIFY ON/OFF-TARGET SITE(S)
Cells lysis and PCR with barcoded primers
3. SEQUENCE
Samples pooled and sequenced on Illumina® platform
ADDITIONAL NGS SERVICES FOR CRISPR VALIDATION
特長と利点
Complete sample-to-answer solution starting from cells to genotype (explore our interactive report; log in required)
Automated, high-throughput workflow – Up to 10,000 samples per run
Hassle-free – Avoid gDNA extraction, pre-screening prior to sequencing, and TA cloning
Highly sensitive – Detection of <1% allele frequency, full INDEL resolution, and frameshift analysis
More reasons to choose GENEWIZ
Additional NGS Services for CRISPR Validation
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Custom Targeted Sequencing
Primer design, amplification, and sequencing of edited and predicted off-target sites -
Amplicon Sequencing
Short- and long-read sequencing options for premade amplicons -
Whole Genome Sequencing
Comprehensive on- and off-target analysis of the entire genome