シングルセルのシークエンシング
ソリューション
細胞集団の特性が均一であったり、類似していることはほとんどありません。従来のバルクRNA-Seqは強力で費用効果の高い解析ツールですが、複雑な環境の中で個々の細胞間に生じる相違を検出することはできません。マイクロ流体力学と分子バーコーディング技術の進歩により、シングルセルの解析に一層の重点が置かれるようになり、不均一な細胞集団の多様性を調べたり、新たな生物学的発見をひも解くことが可能になっています。
Azenta Life Sciencesは、最新技術である10x Genomics® Chromium™を活用したシングルセル解析ソリューションを提供しています。このプラットフォームをいち早く導入＝米国本社では2016年、国内ラボでは初となる2018年、さらに2022年には、豊富な経験と高い技術力により、国内唯一の10x Genomics グローバルCROプログラムに採択されました。
シングルセル遺伝子発現 受託サービス一覧
シングルセルRNA-Seq
トランスクリプトームの不均一性を個々の細胞レベルで解析。Azentaは5’および3’遺伝子発現ライブラリに最も適したワークフローを提供することで、バルクRNAシーケンシングでは見えない細胞の相違を明らかにし、ROSALINDを利用した当社のインタラクティブデータポータルを通じてシークエンシングデータを可視化します。
シングルセルマルチオーム ATAC + RNA
同じ細胞から、遺伝子発現とオープン クロマチンを同時にプロファイリングします。マルチオームATAC-SeqとRNA-Seqで、 すべての細胞のRNAとDNAから遺伝子 調節メカニズムの深い知見が得られます。
細胞表面タンパク質同定・組織からの細胞分散、核抽出にもご対応します。お問い合わせください。
シングルセルシーケンス解析 ワークフロー
1. シングルセル化
細胞とバーコード付きのビーズが、 10x Genomics Chromiumを使用して 液滴中に分離されます
2. ライブラリ調製
ライブラリー作成の前に、各個々の 細胞に対して固有のバーコードが cDNAに付加されます。
3. シーケンス解析
バーコードを付けたライブラリを プールして、イルミナまたはMGIの 次世代シーケンサーを用いて 配列決定します。
4. データ解析
Cell Rangerによる標準解析。 *標準解析以外も承ります。
特長と利点
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メーカーの基準を上回る 優れたデータ品質 -
オンライン注文ポータルを 通じてリアルタイムの プロジェクトアップデート -
PhDレベルの カスタマーサポート
Technical Resources
Webinar Series | Advancing Transcriptomics: Gene Expression Screening, Single-Cell RNA-Seq, and Beyond
With this two-part webinar series, go beyond traditional transcriptomics and learn about the various NGS approaches available for gene expression analysis. In part 1, we take an in-depth look at various gene expression approaches, including RNA-Seq, single-cell RNA-Seq, digital spatial profiling, and more. In part 2, we explore the data generated from these approaches and how they can complement each other and confirm findings.
Webinar: Improving Single-Cell RNA-Seq Workflow Efficiency to Scale Clinical Research
In this webinar co-hosted by Azenta Life Sciences and 10x Genomics, learn how Clinical Research Organizations (CROs) provide expertise across the single-cell RNA sequencing (scRNA-Seq) workflow, including sample prep and experimental execution. This enables pharmaceutical and biotech clients to perform single-cell analysis at greater scale, efficiency, and reproducibility for clinical research.
Poster: Highly Multiplexed Single-Cell Transcriptome and Epigenome Profiling of Cryopreserved Tissue Enables Multi-Omic Tissue Characterization in Clinical Settings
Single-cell analysis typically relies upon immediate processing of fresh tissue, presenting limitations for translational and clinical applications. Learn how Azenta’s robust cryopreservation workflow for downstream processing enabled high-quality, single-cell transcriptomic and epigenomic analysis of translational and clinical samples by coupling scATAC-seq and scRNA-seq.
Tech Note: Add More Life to Your Data: Optimizing Single-Cell RNA-Seq with Dead Cell Removal
Obtaining samples with high cell viability can be difficult for many experiments but is necessary for success on the 10x Genomics® Chromium™ platform. This tech note describes how Azenta scientists used optimized single-cell workflows, including dead cell removal, to overcome low viability and generate high-quality sequencing data.
Webinar: Advancements to the 10x Genomics Chromium™, Single-Cell RNA-Seq System
In this webinar, we review how recent advancements of the 10x Genomics Chromium™ system, coupled with Azenta developmental efforts, can benefit the researcher. In addition, we spotlight the new Single-Cell V(D)J Solution, which can be used in conjunction with single-cell transcriptome profiling to identify pairing of full-length BCR and TCR sequences
Top 3 Factors to Consider Before Starting a Single-Cell Sequencing Project
With several commercial platforms available, high-throughput single-cell sequencing is now more accessible than ever. In this article, we’ll touch upon the 3 most important factors to consider before embarking on your single-cell project to ensure you select the right NGS approach for your research.
Webinar: Towards High Dimensional Sequencing: From Single-Cell to Spatial Omics
In comparison to traditional profiling methods which assess bulk populations, single-cell technologies empower researchers to examine diversity of heterogeneous cell populations and uncover new, and potentially unexpected, biological discoveries. This webinar highlights the unparalleled capabilities of single-cell sequencing.
Case Study: Single-Cell RNA-Seq Analysis Identifies Rare Drug-Resistant Cancer Stem Cells
Cell populations are rarely homogeneous and synchronized in their characteristics. Standard RNA-Seq approaches are limited to reporting general expression levels thus omitting minor subpopulation profiles. This study highlights new single-cell RNA sequencing capabilities for identifying rare cells, characterizing their transcriptomes, and discovering potential biomarkers.
NGS Platforms
Azenta is a certified service provider for Illumina and Life Technology NGS platforms. For information on our NGS platforms as well as recommended configurations of your projects, please visit the NGS Platforms page. Azenta does not guarantee data output or quality for sequencing-only projects.
