OncoGxOne™ディスカバリがんパネル

GENEWIZ OncoGxOne™ディスプレイがんパネルでは、がん研究、バイオマーカー探索、患者の層別化に向けて、包括的なゲノム解析が可能です。最新の研究データをもとに設計・開発されたこれらのアッセイを用いれば、関心のあるがん遺伝子を徹底的に評価できます。  詳しくは以下をご覧ください:OncoGxOne™ディスカバリがんパネルに関してよく寄せられる質問(FAQ).


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Building

用途

がんのメカニズムに関する研究(突然変異を促す新規物質の特定など)
がん治療標的の探索

·         がんバイオマーカー探索

患者の層別化
個別がん治療

特徴と利点


全種類のゲノム異常(一塩基多型(SNP)、挿入欠損、遺伝子融合、コピー数多型(CNV))を検出する能力

19種類のがん特異的パネル

それぞれのパネルによって150~400の腫瘍特異的遺伝子がアッセイされるため、ご希望の遺伝子を柔軟に追加 / 削除できます。

これらのパネルでは、全エクソン / UTR領域、ならびに切断点が示された特定のイントロン領域がターゲットとなります

特定のがんの関心のある部位が徹底的にカバーされるよう設計・検証済み

極めて深いカバレッジで一般的および希少な突然変異を検出

超低量のDNAインプットにも対応

FFPEサンプルとのシーケンシング互換性


関心のある遺伝子を追加できるがんパネルの高いカスタマイズ性

GENEWIZ OncoGxOne™ディスカバリがんパネルのアッセイ対象となっているがんの種類*

  • 膀胱がん
  • 脳腫瘍
  • 乳がん
  • 子宮頸がん
  • 結腸直腸がん
  • 子宮内膜がん
  • 肺がん
  • リンパ腫
  • 黒色腫
  • 卵巣がん
  • 膵臓がん
  • 前立腺がん
  • 甲状腺がん

*(既製のパネルに 遺伝子を追加 / 削除する柔軟性を備えた)他の種類のがんを対象としたアッセイの開発も ご要望に応じて承ります.



がんパネルの比較表


GENEWIZ OncoGxOneTM
ディスカバリがんパネル
Illumina TruSeq©
アンプリコンがんパネル
Ion AmpliSeqTM
がんホットスポットパネル
シーケンシングプラットフォーム Illumina MiSeqまたはHiSeq Illumina MiSeq Ion PGM®
アッセイ対象となるがんの種類 特定の種類のがん(組織)に対応した19種類の固有の遺伝子パネルアッセイ 複数の種類のがんに対応した単一の遺伝子パネルアッセイ 複数の種類のがんに対応した単一の遺伝子パネルアッセイ
カバーされる遺伝子数 ≈150~ 400 48 50
ゲノム変異の検出
  • 点変異
  • 挿入欠損
  • 再構成
  • コピー数多型(CNV)
  • 点変異
  • 挿入欠損
  • 点変異
  • 挿入欠損
ターゲット領域 ≈2~5.4 Mb(すべてのエクソン、UTR、関連イントロン領域で構成) ≈35 Kb(突然変異ホットスポットで構成) ≈39 Kb(突然変異ホットスポットで構成)
平均深度 > 100x* ≈ 1000x** > 10 ng
ターゲットエンリッチメント Agilent SureSelectターゲットエンリッチメント Illuminaターゲットアンプリコンシーケンシング Life Technologiesターゲットアンプリコンシーケンシング
DNAインプット > 100 ng > 250 ng > 10 ng
サンプルの提出
  • FFPE薄片(スライド)
  • gDNA
  • 新鮮凍結サンプル
  • FFPE薄片(スライド)
  • gDNA
  • FFPE薄片(スライド)
  • gDNA

サンプル提出ガイドライン

GENEWIZはがんパネルプロジェクトにおいて、ホルマリン固定 / パラフィン包埋(FFPE)薄片(スライド)、精製ゲノムDNA、新鮮凍結サンプルをお引き受けしています。サンプル提出要件について詳しくは、以下をご覧ください:サンプル提出ガイドライン page.

納品物

いずれのお客様にも生データをFASTQファイルとしてご提出します。ご要望に応じて、突然変異探索およびカスタム式データ解析パッケージもご利用になれます。


次世代シークエンシングプラットフォーム

Azentaは、Illumina認定のサービスプロバイダーです。IlluminaのNovaSeq/HiSeqシリーズに加えて、10X GenomicsのChromium Controller、PacBioのSequelを使用したサービスもご提供しています。詳細は次世代シークエンシングプラットフォームのページをご覧ください>

注文方法


電子メール | 電話(03-6628-2950)